International telepathology consultation: Three years of experience between the University of Pittsburgh Medical Center and KingMed Diagnostics in China Chengquan Zhao, Tao Wu, Xiangdong Ding, Anil V Parwani, Hualin Chen, Jeffrey McHugh, A…

matplotlibでRectangleを2つ描画する時に重複している部分の四角形を描画する． intersectionというらしい．まずは適当な四角形を作る． recs=[] recs.append(matplotlib.patches.Rectangle((10,10),300,60, color='r', fill=False)) recs.append(matplotlib…

２０１４年の日本の論文． Enhancing Automatic Classification of Hepatocellular Carcinoma Images through Image Masking, Tissue Changes, and Trabecular Features肝組織のHE染色スライドを用いて肝生検の組織形態を計測するシステムを作り出して，HCC…

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3017375/ アブストラクト 前立腺癌は前立腺外線に発生する．Gleasonスコアは前立腺癌の予後の重要な因子であり治療にも非常に重要である． しかしGleasonスコアの人による判断は施設によって異なりまたエラーが…

GLCM textual features for Brain Tumor Classification (2012,Zulpe International Journal of Computer Science) GLCMを利用して脳腫瘍を分類した2012年のインドの論文． ClassIとしてアストロサイトーマ（星細胞腫），ClassIIとしてMeningioma(髄膜腫)，C…

またPathology Informaticsの論文である． 組織の画像中でネクローシスを起こしている部分を抽出するのが主目的となっている．ネクローシスを起こしている部分は大体生存している細胞に欠けた部分の周りに，細胞が円を作って整列している．この論文のエッセ…

src/cpp/cuda.hpp:14:18: fatal error: cuda.h: そのようなファイルやディレクトリはありません #include <cuda.h>pycudaをインストールしようとしたときこのエラーがでる． 原因はパスが通っていないから．PATHを以下のように通してから PATH=/usr/local/cuda-7.0/b</cuda.h>…

Chainerを使ってみたかったので何かしら画像分類をしようと思う． あだち充の大ファンであるのであだち分類しようと思ったがさすがに人間に不可能なことは コンピュータにもまだ無理だろうと考えてスネオとトンガリくらいだったらいけると踏んだ．Google画像…

Spindle Cell MelanomaとDesmoplastic Cell Melanomaの分類論文を読んだ。 nuclear circularityの違いにより診断ができるかということをどちらもn=9でImageJを使った閾値の検出で分類を行った論文．ウルム大学（アルバート・アインシュタインの出生の地）の…

京大数学をパソコンで解こうという試み． matplotlib 3Dの勉強をしたいという気持ちからはじめました． 参考にしたのはこちらです．とても勉強になります． http://mathesaurus.sourceforge.net/r-numpy.html まずは京大で良く出るといわれている回転体の体…